受作用的组织、器官的特点 由于各种组织、器官在结构和功能方面都有一定的特异性，因此物理因子作用于不同的组织、器官时，所用的剂量也是有差别的。例如：副鼻窦内的血管较少，对温热的调节性能较差，故超短波作用时剂量不宜过大，眼球含液体较多。
血液循环较差，用超短波、中波、微波治疗眼病时，剂量不应大，如用大剂量的微波作用到眼部，使眼球内部的温度升高到45℃以上时，可引起白内障，而小剂量的微波治疗一些眼的疾患却有良好的疗效。
睾丸组织的血管细小，热调节功能不佳，用超短波，微波等作用时，剂量也以偏低为宜。据实验报告：用同一强度的超声作用于不同的组织——皮炎、肌肉、腹壁、大肠、脊髓腰段后，比较其形态学变化，结果脊髓前角的神经细胞变化最明显，因此，超声波作用于脊髓部时剂量不宜大。
高级神经系统、内分泌腺，生殖器官对物理因子的作用是比较敏感的，这一概念在确定剂量时不应忽略。
（五）理疗方法的作用机理 最后，在确定剂量时，还应考虑所使用的物理疗法的具体作用机理，例如电兴奋疗法治疗神经衰弱和领区直流电药物离子导入治疗神经衰弱的作用机理是截然不同的，前者是通过兴奋诱导大脑皮质的抑制过程，后者则是通过节段反射的作用调节大脑皮质的基本神经过程。
虽然两种疗法的最终作用效果可能是相同的，但由于它们各自的作用机理不同，故电兴奋治疗时使用偏大的剂量，而领区直流电药物离子导入治疗时使用偏小的剂量。
实验研究和临床观察还发现：对冠心病患者为改善植物神经对心脏的调节功能，冠状血循和心肌功能，使用近于生物电的弱直流电疗法是有益的